這兩種發票所交納的稅率是不一樣的，小規模納稅人的稅率自2009年開始是3%，一般納稅人的稅率是17%。其納稅計算方式為先由進項抵銷項，再乘以稅率。貿易公司企業所得稅有兩種征收方式，即查帳征收與核定征收，這兩種征收方式的稅率也不同。地方附加稅包括城市維護建設稅、教育附加稅、河道管理費，其是根據貿易公司交納的營業稅計算的，稅率如下，。如果貿易公司交納100元的營業稅，那么其所交納的城市維護建設稅為1元。如果貿易公司交納100元的營業稅，那么其所交納的教育附加稅稅為3元。如果貿易公司交納100元的營業稅，那么其所交納的河道管理費為1元。除地方附加稅外，貿易公司其它稅種稅率是全國統一的。
貿易公司注冊好后默認為小規模納稅人，若開具增值稅專用發票，需申請一般納稅人資格。小規模納稅人開普通銷售發票，一般納稅人開具的發票是增值稅專用發票。這兩種發票所交納的稅率是不一樣的，小規模納稅人的稅率自2009年開始是3%，一般納稅人的稅率是17%。
貿易公司無論是小規模納稅人還是一般納稅人都需交納營業稅及地方附加稅。
一、貿易公司增值稅稅率
1、小規模納稅人稅率為：3%。其納稅計算方式為開票額X3%。
2、一般納稅人稅率為：17%。其納稅計算方式為先由進項抵銷項，再乘以稅率。
二、貿易公司企業所得稅稅率
貿易公司企業所得稅有兩種征收方式，即查帳征收與核定征收，這兩種征收方式的稅率也不同。
1、所得稅查帳征收：適用財務會計核算規范的企業，按收入減成本費用后的凈利潤計算企業所得稅，稅率為25%。
2、所得熟核定征收：是對能夠正確核算收入而不能正確核算成本費用的企業適用，按開票額計算企業所得稅，稅率為1%%，如果貿易公司開票額為100萬元人民幣，按核定征收所交納的企業所得稅為1萬元人民幣。
在上海注冊的貿易公司，公司注冊完成后前三個月企業所得稅是查帳征收，三個月后可以申請核定征收。
三、貿易公司地方附加稅
地方附加稅包括城市維護建設稅、教育附加稅、河道管理費，其是根據貿易公司交納的營業稅計算的，稅率如下：
1、城市維護建設稅：稅率為1%。如果貿易公司交納100元的營業稅，那么其所交納的城市維護建設稅為1元。
2、教育附加稅：稅率為3%。如果貿易公司交納100元的營業稅，那么其所交納的教育附加稅稅為3元。
3、河道管理費：稅率為1%。如果貿易公司交納100元的營業稅，那么其所交納的河道管理費為1元。
四、貿易公司稅收優惠政策
除地方附加稅外，貿易公司其它稅種稅率是全國統一的。貿易公司的稅收優惠政策主要體現在返稅上。以注冊上海貿易公司為例，其享受的稅收優惠政策如下：
在上海郊區開發區注冊貿易公司，可以享受高額的返稅優惠政策，營業稅可返到實際交稅額的20-45%，企業所得稅可返實際交稅額的10-18%。
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